ヌマエビはメダカとの相性がよく、水温や水質もメダカの飼育環境と近いため通年混泳させることが可能です。（※メダカの成魚が稚エビを捕食することがあるため、水草や流木などで稚エビの隠れ場所を用意する必要があります。）ヌマエビがメダカを襲うことはなく、メダカのエサの食べ残しを食べることで食べ残しが無駄にならないため、水質悪化を防いでくれます。
さらにヌマエビはアンモニア、亜硝酸、硝酸塩、水温や水質などの環境の変化対してメダカよりも敏感に反応するため、水質のバロメーターにもなります。

エビと比べると少し地味な貝類ですが、メダカの残り餌や水垢などを食べてくれるなど何かと役立つ存在です。
またメダカを襲う心配がないので安心して共存させることができ、水底に落ちたメダカの卵を食べることもありません。
（※但しスネールと呼ばれる貝類は異常な繁殖力であっという間に水槽を埋め尽くすくらい増えるため、見つけたら駆除することをオススメします。）特にコケが気になるという方には、是非水槽に導入していただきたい生物です。